Baseado na clássica ópera de Moszart, A Flauta Mágica conta a história de um jovem músico que acaba mergulhando de cabeça na lenda do instrumento fantástico. No filme de fantasia, um estudante de música inglês consegue uma vaga em um renomado conservatório na Áustria, terra de Moszart. Entre partituras e instrumentos, ele acha uma porta secreta que o leva para uma dimensão alternativa e para uma aventura em busca da lendária flauta mágica.